تختص الإدارة بإعداد المخطط الهيكلي العام والمخطط التنفيذي لإمارة الفجيرة , و إعداد وتحديث ومتابعة تنفيذ التخطيط العمراني الشامل والتفصيلي للإمارة وتحديد وتنظيم استعمالات الأراضي , كما تقوم باقتراح ومتابعة تنفيذ السياسات والتشريعات والقوانين والأنظمة والإجراءات الخاصة بالتخطيط العمراني للإمارة والتدقيق على تصاميم البناء وفقاً لهذه التشريعات. ووضع آلية التعاون مع القطاع الخاص والعام للمشاركة في عملية التطوير العمراني , وهي الإدارة المسؤولة عن إعتماد جميع مشاريع البنية التحتية في إمارة الفجيرة , وتضم الأقسام التالية :

تختص الإدارة بتحديد وتنظيم استعمالات الأراضي , و إعداد وتنفيذ السياسات الإسكانية في نطاق إختصاص بلدية الفجيرة , كما تساهم في توفیر الوحدات السكنیة للمواطنین المستحقین، وفقاً للقوانین والنظم المعمول بھا , بالإضافة إلى توثيق سجلات الأراضي المخصصة لطلبات الإسكان والمنح الخاصة , وتضم الأقسام التالية :

تختص الإدارة بضمان تحقيق الصحة العامة في الإمارة , و حماية افراد المجتمع من الامراض المنقولة من خلال الغذاء والمياه والمنشآت الصحية المهنية من خلال تطبيق القوانين والتشريعات الاتحادية والمحلية والمواصفات القياسية ذات العلاقة بالصحة العامة و استحداث و تطوير اللوائح الفنية و التشريعات وأدلة العمل والأدلة الإرشادية ذات العلاقة بالصحة العامة , وهي الإدارة المسؤولة عن ضمان تحقيق النظافة العامة في الإمارة والحفاظ على المظهر الجمالي بالإضافة إلى ضمان الأمن الغذائي والحيوي والبيولوجي وتضم الأقسام التالية:

تختص الإدارة بتهيئة بيئة الأعمال الجاذبة للاستثمار وتعزيز النمو الاستثماري في الامارة ل ضمان تنوع اقتصادي ملائم لمتطلبات المستثمرين والاتجاهات المحلية والعالمية , كما تعمل على المساهمة في إعداد مشروعات التشريعات المنظمة للنشاط الاقتصادي والاستثماري لدعم البيئة الاستثمارية في الامارة ودراسة وتحليل ومتابعة الإتجاهات والمؤشرات والمتغيرات الإقتصادية العالمية والإقليمية والمحلية , وتضم الأقسام التالية:

تختص الإدارة بإدارة كافة الأنشطة المتعلقة بإدارة قنوات الاتصال مع المتعاملين ومنظومة الشكاوى والاستفسارات والاقتراحات التي ترد منهم و تطوير وتحديث قنوات وبرامج التواصل مع المتعاملين، لتتلاءم مع احتياجاتهم وفقا لمختلف انماطهم وجنسياتهم وثقافاتهم من خلال إجراء المقارنات المعيارية بشكل دوري وتطبيق المبادرات والمشاريع التي من شأنها تامين مستوى خدمات متميزة لكافة المتعاملين بالبلدية، و جمع البيانات والاحصائيات المتعلقة بمجالات خدمة المتعاملين عبر قنوات الاتصال المختلفة ومراكز خدمة العملاء , كما هي الإدارة المسؤولة عن قياس مستوى رضا المتعاملين عبر تنفيذ استطلاعات الراي وبالطرق والاليات التي تلاءم احتياجات وثقافات المتعاملين , وتضم الأقسام التالية:

تختص الإدارة بضمان التخطيط السليم لإدارة الموارد والأصول المؤسسية في البلدية و تنفيذ كافة الأنشطة المتعلقة بإدارة الموارد وتوزيعها بالطريقة المثلى من خلال رسم وتنفيذ السياسات والخطط ذات العلاقة بعملها والإشراف على العمليات والمشاريع الرئيسية الداعمة لعمل البلدية ضمن نطاق الدعم المؤسسي , وهي الإدارة المسؤولة عن تزويد البلدية بجميع المعدات والأجهزة والأصول الأخرى وتعزيز كفاءتها وفاعليتها من خلال خطط الصيانة الدورية والوقائية , وتضم الأقسام التالية:

تختص الإدارة برسم خارطة الأداء وضمان الاتجاه العام للبلدية , من خلال الدراسة والتحليل للإداء العام للبلدية واعداد الخطط التي تضمن التطوير العام للبلدية وعملياتها وخدماتها , كما تقدم الإدارة ب انجاز كافة الأنشطة المتعلقة بإعداد الخطة الاستراتيجية والتشغيلية للبلدية وأنشطة متابعة وتقويم الأداء والأنشطة المتعلقة بتطوير الخدمات وتنفيذ معايير وبرامج الجودة والتميز وأنشطة المعرفة والإبداع والابتكار والاستعداد للمستقبل وإدارة وتحليل وتفسير ونشر البيانات الإحصائية , وهي الإدارة المسؤولة عن ضمان مستوى الأداء العام للبلدية والتأكد من الكفاءة والفاعلية في تطبيق الخطة الاستراتيجية وعناصرها والمؤشرات التشغيلية للبلدية , وتضم الأقسام التالية: